甘肃省敦煌种业股份有限公司是为搭建融资平台，加快区内优势产业发展而整合、重组酒泉境内的国有种子公司和棉花公司所设立的股份制企业，公司于1998年底经省人民政府批准设立，2003年12月29日公开发行7500万A股股票，2004年1月15日在上海证券交易所挂牌上市。
公司成立以来，在做强做大种子、棉花产业的基础上，采取合资合作、吸纳整合优势资源、加大项目建设投资力度、组建营销网络体系等方式，促进了公司快速发展。公司现有注册资本1.86亿元，总资产25.25亿元，分（子）公司28家，行业涉及种子、棉花、食品、证券投资等领域，共有员工1280余人。
公司依托河西走廊优越的自然资源和良好的农业生产基础条件，实行“公司联基地”、“基地联农户”的产业化经营模式，建立了60万亩稳定的制种基地和国内一流的大型种子加工生产线，拥有一整套国内同行业领先的从亲本提纯、扩繁、田间去杂、去雄授粉、清杂晾晒到收贮保管等过程的质量控制技术操作规程，建立了完善的种子质量控制体系，并通过委托育种、合作育种、联合开发、合资合作、整体吸纳、买断产权品种等形式，拥有玉米、小麦、水稻等自有知识产权品种共六十多个，形成了覆盖全国不同生态区的市场营销网络，年产销玉米、小麦、水稻、瓜类蔬菜、棉花等各类农作物种子近1亿公斤。2006年，公司与世界500强企业美国杜邦集团先锋良种公司合资合作，投资2000万美元设立了敦煌种业先锋良种有限公司，利用先锋优势品种，扩大和提升中国玉米杂交种市场份额和品位，市场竞争实力大幅提升。
